Com o início da colonização alemã em Santa Cruz do Sul, surge a necessidade da construção de um hospital para atender as exigências – cada vez mais crescentes – da população na área da saúde. Sob a iniciativa do padre Francisco Suzen, a comunidade realiza uma campanha para arrecadar donativos, material e mão-de-obra voluntária para que a obra tivesse início. No entanto, a situação financeira da colônia exige a interrupção da iniciativa, a qual só seria retomada mais tarde, após a chegada das irmãs franciscanas à localidade.
O ano de 1893 marca a chegada das religiosas da Ordem de São Francisco a Santa Cruz do Sul. Após encontros e debates com a comunidade, a madre geral da congregação, irmã Ludmila, propõe o irrecusável: as irmãs cederiam o terreno de sua propriedade e profissionais da área da saúde e manteriam a instituição, enquanto que a comunidade ficaria responsável pela edificação do estabelecimento.
A campanha de arrecadação de fundos é retomada e, mesmo com diversas dificuldades, a construção tem início em 1905, sendo concluída em novembro de 1907. As atividades do Hospital Santa Cruz, finalmente, têm início em 22 de maio de 1908, tendo o alemão Heinz Von Ortenberg à frente dos trabalhos como médico chefe da casa de saúde. Alternando a residência em Santa Cruz com a participação nas duas guerras mundiais, Ortenberg confere, desde cedo, o caráter humanista que o Hospital Santa Cruz adquirira com o passar dos anos, atendendo gratuitamente as camadas mais humildes da população. Esse perfil de atendimento seria fortalecido com a administração empreendida pelas irmãs, guiadas pelos ideais franciscanos de generosidade, fraternidade e apoio aos mais necessitados.
Entre as décadas de 70 e 90, a instituição passa por reformas, ampliações e inauguração de novos serviços. Informatização de diversos setores, a ampliação da UTI Adulto, a criação da UTI Neopediátrica e do setor de Pneumologia e Cirurgia Torácica são alguns dos acontecimentos que marcaram esse período.
Em 30 de junho de 2003, o Hospital é adquirido pela Associação Pró-Ensino em Santa Cruz (Apesc), com o foco voltado na ética, seriedade e transparência que caracterizam a entidade. Assim, o Hospital Santa Cruz inicia uma nova fase, dando continuidade ao atendimento das demandas em saúde da comunidade do Vale do Rio Pardo. Em 2012, obtém a certificação definitiva como Hospital de Ensino, oferecendo hoje seis programas de residências médicas e um programa de residência multiprofissional que contempla cinco áreas de concentração.
A habilitação como Centro de Referência em Alta Complexidade Cardiovascular vem pouco tempo depois, em 2014. Com ela, o HSC é credenciado a realizar procedimentos endovasculares extracardíacos e de eletrofisiologia pelo Sistema Único de Saúde (SUS). Os serviços abrangem a 8ª e a 13ª Coordenadoria Regional de Saúde, representando mais de 600 mil habitantes de 25 municípios dos vales do Rio Pardo e do Jacuí.
Em dezembro de 2016, a Instituição conquista a habilitação de Unidade de Alta Complexidade em Terapia Nutricional Enteral e Parenteral e, desde 2018, é Unidade de Referência em Oftalmologia. Também atinge o nível 3 de excelência para a UTI Adulto, que é o máximo que pode ser alcançado por uma UTI.
Com a pandemia da Covid-19, o HSC passa por uma profunda reestruturação de sua parte física e do seu fluxo de atendimento a partir de março de 2020, tornando-se referência no atendimento para pacientes com coronavírus. Com o avanço da vacinação e redução no número de casos, os serviços e atendimentos começam a ser reestabelecidos em 2021 e, no ano seguinte, é inaugurada a UTI Adulto 2, com mais 10 leitos.
Ainda em 2021, o Hospital Santa Cruz é certificado com o Nível 1 do principal selo de qualidade nacional concedido às instituições de saúde: a Acreditação Hospitalar. A conquista coloca o HSC em um seleto grupo de hospitais brasileiros que são Acreditados pela Organização Nacional de Acreditação (ONA), entidade não-governamental e sem fins lucrativos que certifica a qualidade de serviços de saúde no Brasil, com foco na segurança do paciente. No final de 2023, o Hospital é certificado com o Nível 2.
Com a Acreditação, a instituição de saúde atinge o mais alto patamar de credibilidade, garantindo uma gestão eficiente de recursos e harmonia na integração entre todos os setores e profissionais, por meio da adoção de protocolos reconhecidos, processos bem definidos e funções específicas, gerando um quadro de padronização que advém à referida qualidade assistencial. Para isso, o HSC promoveu uma série de ações desde 2018 com o objetivo de aprimorar ainda mais os recursos humanos existentes, uniformizar os processos e qualificar as estratégias de gestão.
Já em 2024 o Hospital Santa Cruz passa por mais uma restruturação em sua gestão. Após 10 anos como diretor-geral da casa de saúde, o professor Vilmar Thomé passa o cargo para o também professor da Unisc, Rolf Fredi Molz. No final do mesmo ano, é inaugurado o espaço destinado para a UTI Pediátrica, com cinco leitos, mantendo a UTI Neonatal com 10 leitos, agora em ambientes distintos e com equipes específicas atendendo à Portaria do Ministério da Saúde.
O ano de 2025 é marcado na Instituição pela reinauguração do Centro de Terapia Endovascular – Hemodinâmica, com a presença do governador Eduardo Leite e da secretária da Saúde do Estado (SES), Arita Bergmann. A sala esteve fechada por três meses para obras de adaptação e remodelação com o objetivo de receber o novo aparelho de angiografia digital, adquirido com investimento de R$ 3.972.489,67 do Programa Avançar Mais na Saúde, do governo estadual.
Confira o Vídeo Institucional do Hospital Santa Cruz:
